Для начала повторим принцип работы. Накопленная конденсатором энергия с определёнными потерями (возьмём КПД 30% как наиболее вероятную цифру (меньше вряд ли, больше - сложно :-) так что это потом) переходит в кинетическую энергию снаряда. При этом снаряду может быть сообщена дополнительная кинетическая энергия (можно ускорять снаряд пневматически, пружиной или даже пушкой Гаусса). В общем вот :
Находим энергию конденсатора
Изменение кинетической энергии равно произведению КПД и энергии конденсатора
Находим кинетическую энергию как сумму начальной кинетической энергии и полученной в результате разрядки батареи